阿里地区待遇服务中心

负责对地直单位城镇职工基本医疗保险、城镇职工生育保险、城乡居民基本医疗保险、城乡居民生育的待遇审核、结算工作；负责全地区离休干部、十八军（四路进藏）退休老同志和其他特殊人群医疗保障待遇审核、结算工作；负责全地区城镇职工基本医疗保险、城乡基本医疗保险参保人员医疗救助待遇的审核、结算工作；负责全地区城乡居民大病保险协议签订及赔付情况的追踪调查工作；负责基本医疗保险与定点医疗机构和定点零售药店医疗服务协议管理和医疗费用的审核、结算工作；负责指导和规范全地区基本医疗保险、生育保险、医疗救助待遇审核、结算业务流程和经办工作。

阿里地区医疗基金结算中心

负责全地区城镇职工基本医疗保险、城镇职工生育保险、城乡居民基本医疗保险基金筹集和支付工作；负责全地区医疗保障基金报表编制和报送工作；负责基本医疗保险与定点医疗机构和定点零售药店医疗费用的复核、支付工作；负责全地区干部职工体检费拨付工作；加强基金的财务管理，确保基金安全与完整；负责指导和规范全地区基本医疗保险经办机构基金财务工作。

阿里地区医疗保障信息数据管理中心

负责地区机关、企事业单位在职、退休人员和城乡居民基本医疗保险及生育保险参保信息登记、申报核定、关系转移、资格认定；负责全地区基本医疗保险个人账户管理；负责全地区信息系统维护工作；负责全地区医疗保障统计报表编制和报送工作；负责全地区城镇职工大额医疗费商业补充保险和城乡居民大病保险参保人员信息报送工作；负责全地区跨省异地就医登记备案工作；负责全地区医疗保障社会化服务工作。